Необходимо написать расширение конфигурации в 1С БП
из документов "заказ кодов маркировки" осуществить выгрузку кодов маркировки в формате csv
в "документы ИС МП" загрузку подобного файла для дальнейшей отправки в ЧЗ
Есть расширение, которое работало год назад на соответствующей версии, можно изменить ошибки в том расширении